Workflow pour l'analyse de données

Créer un dossier qui contiendra les scripts, les notes et les données (ou un
lien vers les données).

• versionner le dossier avec git
• RStudio pour le traitement des données
• knitr + Markdown pour les notes

Pas besoin de dater ou signer le document (Rpubs et git contiennent déjà ces
informations).

Externaliser le code du Rmd dans un fichier source qui pourra être
implicitement (echo=FALSE) inclus dans un futur rapport.

Toujours fixer la graine.

Ne jamais revenir en arrière sans commiter le Rmd. Lorsque l'analyse a atteint
une étape importante (pas forcément le jour-même mais lorsque des conclusions
sont déjà disponibles), commiter, publier le rapport sur Rpubs et commencer une
nouvelle analyse.

Générer les figures finales avec un second device en pdf en plus du png (sauf
si leur taille est prohibitive).